En los territorios bajos se encuentra un mosaico de bosques primarios y secundarios maduros, así los bosques nubosos premontanos se localizan en los cerros de mayor altura del parque lo que produce endemismo en la región. En general, ofrece al visitante la variedad de flora y fauna característica del bosque tropical muy húmedo. Dentro de las especies de árboles podemos citar el fruto dorado (Virola sp.) el pan de leche (Sterculia mexicana), el caluga (Poulsenia armata), Ceiba (Ceiba pentandra), Palma yolillo (Raphia taedigera), el ajo (Caryocar costarricensis), y diferentes tipos de mangle, entre otros.

En Corcovado, se puede apreciar arrecifes coralinos, playas, ríos y lagunas. Además es considerado un laboratorio científico, en cual se cree que está la respuesta a muchas enfermedades y mejora de la agricultura.

La Laguna de Corcovado es uno de los tesoros naturales con que cuenta el área, su belleza consiste en que está rodeada de pantanos de palma y de bosques de gran interés, generalmente se encuentra inundada por los ríos Corcovado y Sirena. Se cree que la laguna fue una bahía oceánica que cambió su estructura y que hasta el momento no se ha llenado de los sedimentos necesarios para que sea así. Ésta sirve de hábitat para plantas acuíferas, las cuales se pueden observar flotando en la superficie. Los árboles que crecen cerca de este ecosistema se ven frecuentemente inclinados  ya que carecen de un sistema radical que le permita adaptarse a este suelo cenagoso. Las grandes cantidades de agua que contiene la laguna en muchas ocasiones logran causar la inundación del yolillal vecino.

Una de las características que puede generar interés es el hecho de que existen evidencias de antiguos túneles de orería, lo que puede ser beneficioso para el turismo si se toman medidas de seguridad a favor del visitante y el ambiente. El turismo ha generado ingreso para la población vecina del parque, lo que crea una ventaja para que los pobladores se conciencicen y protejan sus intereses y de paso el medio, el cual es un factor indispensable para que se de dicha actividad.